中世纪时，西班牙曾长期被摩尔人统治。摩尔人也带来了他们的文化和宗教传统，建造了大量的清真寺。其中一些清真寺后来被改建为基督教教堂，另一些则留存至今。
位于格拉纳达的阿尔罕布拉宫圣玛利亚教堂前身为清真寺，后经天主教君主改建，但仍保留了原有的摩尔建筑结构。位于托莱多的圣地亚哥-阿拉巴尔教堂在十二世纪被改建成教堂之前，原本也是清真寺。位于塞维利亚的希拉尔达塔原是十六世纪西班牙最重要的清真寺之一，当时塞维利亚是阿蒙哈德帝国的首都。不过如今，这座清真寺几乎已面目全非。位于安达卢西亚的科尔多瓦大清真寺无疑是摩尔建筑中最著名的典范之一。公元785年，它在一座基督教教堂的基础上修建而成，后来又在十三世纪再次被改建为教堂。
安达卢西亚或许是清真寺最密集的地方，但托莱多的清真寺保存得最完好，比如托尔内利亚斯清真寺（如今是艺术和工艺品中心）、光辉基督清真寺、萨尔瓦多教堂等。
更现代的清真寺包括位于马德里的两座伊斯兰清真寺。位于科尔多瓦的巴沙拉特清真寺建于1982年，是15世纪穆斯林统治结束以来在西班牙修建的第一座清真寺。